在上海办理铁路工程施工总承包二级资质时，需要注意以下几个关键点：
资质标准确认：确保企业满足二级资质的具体要求。根据最新的信息，这通常包括企业净资产达到4000万元以上，拥有不少于8名铁路工程专业一级注册建造师，以及一定数量的技术负责人和中级以上职称技术人员等。
政策与规定：深入了解并遵循国家及上海市关于铁路工程施工总承包资质的最新政策、规定和标准。这些规定可能会随时间调整，因此获取最新的官方文件和指导是非常重要的。
人员配置：确保企业拥有所需的专业技术人员，包括注册建造师、技术负责人、中级工程师及各类现场管理人员等，并且他们的资格证书需有效且符合资质标准。
注册资本：企业注册资本需要满足要求，如果不足，需向当地工商管理局提出增资申请。
业绩要求：部分资质申请可能要求企业提供相应的工程业绩证明，确保企业的过往项目记录符合申报要求。
申请流程：熟悉并严格遵循资质申请流程，这可能包括准备申请材料、在线申报、提交纸质材料、参加审核评估等多个步骤。
资料准备：全面且准确地准备申请所需的所有资料，包括但不限于企业法人营业执照、财务审计报告、技术人员资格证书、安全生产许可证等。
合规性审查：在提交申请前，进行自我检查，确保所有提交的信息真实有效，避免因虚假信息导致申请被拒或后续处罚。
持续关注：在申请过程中，保持与相关部门的有效沟通，及时了解申请进度，并对反馈意见迅速响应。
时间规划：考虑到资质办理可能需要2-3个月的时间，合理规划时间，提前启动申请程序，以避免影响企业参与项目招投标的计划。