办理上海古建筑工程专业承包二级资质，需要遵循一系列具体步骤并满足相关要求。根据您提供的信息和一般流程，以下是一个概括性的指南：
满足基本条件：
- 企业资产：确保企业净资产不低于1000万元人民币。
- 企业主要人员：包括但不限于建筑工程专业注册建造师不少于5人，其中至少有一级注册建造师；技术负责人需具备8年以上相关工作经验，持有工程序列高级职称或建筑工程专业一级注册建造师执业资格，同时结构、风景园林等专业中级以上职称人员不少于5人，专业需齐全。
企业工程业绩：
- 近5年内承担过至少2类或某1类中的2项古建筑工程，且工程质量合格。具体的工程类型和规模需参照最新标准。
技术装备：
- 配备与承包工程范围相适应的施工机械和质量检测设备，确保能高效、安全地进行古建筑施工和修复工作。
管理体系：
- 建立并维护一个完善的企业质量管理体系，确保其有效运行，符合行业规范和监管要求。
准备申请材料：
- 包括单位资质申请表、法人证明文件（如营业执照）、技术人员及工程序列职称证明、学历证明、社保证明、技术设备清单及技术证明材料、工程业绩证明（如合同、验收报告）、安全生产许可证等。
提交申请：
- 将准备好的所有材料提交给上海市住房和城乡建设委员会或其指定的审批机构，可能需要通过线上系统提交和预约现场审核。
审核与现场勘查：
- 提交的材料将经过相关部门的审核，必要时会安排现场勘查，以验证企业实际情况与申请材料的一致性。
领取资质证书：
- 审核通过后，企业将被通知领取古建筑工程专业承包二级资质证书。
请注意，以上步骤和要求可能会随政策调整而有所变化，因此，在正式申请前，务必访问上海市住房和城乡建设委员会官方网站或直接咨询相关部门，获取最新的申请指南和具体要求。