要新办上海机电工程施工总承包二级资质，您可以采取以下几个策略来确保流程顺利进行：

1. 彻底了解资质标准

• 企业资产：确保企业的净资产达到4000万元以上。
• 注册建造师：至少有5名机电工程、建筑工程专业注册建造师。
• 技术负责人：技术负责人需要有8年以上从事工程施工技术管理工作经历，并且必须具有相关专业中级以上职称或机电工程专业注册建造师资格。
• 项目管理人员：企业应具有机电工程施工项目管理人员不少于3人，其中高级职称人员不少于1人。
• 其他技术人员：具备与机电工程施工相关的专业技术人员，如电气工程师、机械工程师等。

2. 准备申请材料

• 企业法人营业执照：提供最新的企业法人营业执照复印件。
• 财务审计报告：提供最近一年度的财务审计报告。
• 技术人员资格证书：提供技术人员的资格证书复印件。
• 社保缴纳证明：提供企业为技术人员缴纳的社会保险证明。
• 业绩证明：虽然不再考核企业工程业绩，但可能需要提供一些已完工项目的证明材料以证明企业的实际能力。
• 其他相关材料：根据具体要求提供其他必要的文件和证明材料。

3. 内部自审

• 在正式提交申请前，组织内部或聘请外部专家进行全面的自审，确保所有材料准确无误，避免因资料问题被退回重审。
• 检查是否有遗漏的文件或错误的信息，并进行修正。

4. 使用官方平台提交申请

• 通过上海市“一网通办”平台或者市住房城乡建设管理委官网的“企业类办事一本市企业资质申请一建筑业（施工）”栏目提交申请。

5. 跟进审批进度

• 定期跟进审批进度，了解审批状态，以便及时处理可能出现的问题。
• 保持与相关部门的良好沟通，了解审批过程中可能出现的任何额外要求或变更。

6. 注意事项

• 政策变化：密切关注政策变化，确保所有申请材料符合最新的资质标准。
• 费用缴纳：在申请过程中可能需要缴纳一定的费用，请提前了解清楚并做好准备。
• 咨询专业人士：如有必要，可以咨询专业机构或顾问，以获得更专业的指导和支持。

确保在准备申请材料时仔细阅读最新的政策文件和指南，以保证所有提交的材料符合当前的要求。此外，如果在申请过程中遇到任何问题，及时与上海市住房和城乡建设管理委员会联系寻求帮助。