上海环境工程设计专项乙级资质的企业是可以从事中型以下规模环境工程的专项设计工作，这通常包括了水污染防治工程、大气污染防治工程、固体废物处理处置工程、物理污染治理工程等。如果涉及到需要设计设备的地基基础图纸，并且这些图纸属于上述环境工程项目的一部分，那么拥有乙级资质的设计单位应该是能够提供这类设计服务的。

但是，需要注意的是，如果地基基础工程的设计超出了环境工程设计专项乙级资质所涵盖的范围，或者需要更专业的地基基础工程设计，则可能需要由具备相应地基基础工程设计资质（如地基基础工程专业承包资质）的设计单位来完成。

具体来说，地基基础工程乙级资质可以承担的是特定高度限制下的建筑物和构筑物的地基基础工程施工。因此，如果设备的基础设计不超出这些限制，并且紧密相关于环境工程项目的实施，乙级环境工程设计资质的设计单位可以完成该设计工作。然而，对于复杂或特殊要求的地基基础设计，可能还需要咨询具体的资质要求和地方性法规。在实际操作中，最好直接咨询当地的建设管理部门或相关资质评审机构，以获取最准确的信息。